传达吧波导！小智跟不可思议的蛋！！小春与来电汪、还有神出鬼没的耿鬼

宝可梦的蛋据说还有很多谜团。小智和小豪实为了寻找蛋而去寻找它，但是蛋并不是那么容易就能找到。在这期间，他们在顺路去的口袋妖怪中心，遇到了长时间孵化不出来的不可思议的蛋。乔伊把这颗宝可梦蛋交给小智那里得到了蛋，让他照顾这颗蛋，里面的宝可梦能否顺利孵化出来呢？虽然有身为宝可梦博士的父亲，但小春本人对宝可梦却很冷淡。尽管家里的来电汪与她亲近，但周围充斥着“博士的女儿喜欢宝可梦是理所应当的吧”这样刻板的声音，对此小春很是心怀芥蒂。就在这时，樱木研究所出现了一只让大家头疼的谜之耿鬼……