祝福你们！直至再会那一天!!

小智一行人坐船到关都地方的港口城市·枯叶市。在杰可罗拉群岛旅行的日子也即将完结。火箭队无论如何，都想在小智他们到达关都之前捉走皮卡丘，他们用巨型的气球把客船吊起，使客船充满混乱。火箭队像平常一样抢夺小智他们的神奇宝贝，但今次帕卡先生竟然协助火箭队的恶行？